Hola, te daré unas pistas que pueden servirte.
Poner subtítulos permanentes (para grabar posteriormente a VCD):
Para eso lo que tienes que hacer es adherirle los subtítulos. Búscalos en páginas de subtítulos (como
http://www.subdivx.com,
http://extratitles.to, etc.).
Posteriormente es necesario re-encodear el video, usando el VirtualDUB, agregándole un plug-in especial. Este plug-in necesita que los archivos de subtítulos estén en formato SSA. En caso que no estén en ese formato, hay programas para convertirlos de un formato a otro (yo uso el SubRip). Se ve bastante enredado

, pero hay tutoriales para hacerlo paso a paso, como por ejemplo
AQUI Para ver subtítulos mientras lo reproduces en tu PC:
Instala el VobSub y ya
Saludines